代谢组学
代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新发展起来的一门学科，它通过对机体内小分子代谢物（50~1,500 Da）进行精准定性定量，分析代谢物与机体生理、病理变化的关系，从而研究植物抗逆、工业微生物提产、疾病发生发展、寻找疾病生物标记物等内容。 专业服务类型包括：² GC-MS 平台提供对代谢物的无目标性广筛，并使用业界公认的GMD 代谢组数据库实现对代谢物的相对定性定量分析² LC-MS 平台提供对代谢物的无目标性广筛，使用Metlin 数据库完成对代谢物的相对定性定量分析² NMR 平台提供对340 余种水溶性初生代谢物小分子的绝对定性定量检测分析² GC-FID 平台提供对37 种脂肪酸的绝对定性定量检测分析² LC-MS 平台提供对甘油三酯的绝对定性定量分析² Shotgun MS 平台提供对甘油磷脂的绝对定性定量检测分析² LC-MS 平台提供对10 种植物激素的绝对定性定量分析 文献解读血浆蛋白质组和代谢组研究人类甲状腺功能亢进模型Plasma proteome and metabolome characterization of an experimental human thyrotoxicosis model研究单位:格赖夫斯瓦尔德大学发表时间:2017年1月发表杂志:BMC Medicine影响因子:8.097一、研究背景 目前临床将检测促甲状腺激素(TSH)和游离甲状腺素(FT4)的含量作为诊断与随访甲亢的“金标准”。但由于干扰TSH和FT4含量的因素众多,经常出现检测结果与临床症状不一样的情况。临床迫切需要找寻能够表征甲亢的新的生物标志物。二、研究策略 三、研究结果1.代谢组、蛋白组数据统计后续针对样本进行代谢组与蛋白质组检测,共鉴定到380种代谢物与497种人类蛋白质。2.差异代谢物功能富集分析及机理研究349种代谢产物中65种(19%)显著差异,其 中45种表达量上调,20种表达量下调。大部分 差异代谢物为脂质代谢物和相关化合物(见图1)。 3.Biomarker筛选为了寻找新的biomarker来分类TH状态,研究者通过两阶段交叉验证程序建立了一个随机森林分类器,综合分析代谢组和蛋白质组发现...
2019
-
03
-
21